毛细管气相色谱仪进行剖析时，有手动进样和自动进样两种方法，手动进样运用微量注射器直接进样，应选用体积适宜的注射器，进样时要求注射速度快，取样精缺、重现，防止样品之间的穿插污染，自动进样选用自动进样器，通常具有可变的注射速度、宽范围的进样体积、适用于多种进样模式等功能。在气相色谱仪的支持下，对样品溶液中未知组分保存时刻有用检测，且对比剖析标准溶液同一色谱柱中的保存时刻，对样品溶液中的组分类别合理区别，进而对各个组分含量合理核算。如果两者保存时刻具有0.5min以上的距离，通过外标法的使用，定量处理农药含量，对回收率科学测定，以便促进检测结果的精缺性、真实性得到确保。

　　毛细管气相色谱仪的温度设置不应低于色谱柱实际工作的标准温度，一旦检测器被污染，轻则灵敏度下降或噪声变大，重则点不着火，消除污染的办法是清洗，主要是清洗喷嘴外表和气路管道。具体办法是拆下喷嘴，依次用不同的溶剂浸泡，并在超声波水浴中超声10分钟以上，还可用细不锈钢丝穿过喷嘴中间的孔，或用酒精灯烧掉喷嘴内的油状物，以达到彻低清洗的目的。有时运用时刻长了，喷嘴外表会积碳，这会影响灵敏度。可用细纱纸轻轻打磨外表除掉。清洗之后将喷嘴烘干，再装在检测器是进行测定。

　　FID是用氢气和空气焚烧所发生的火焰使被测物质离子化的，故应留意铵全问题。在未接色谱柱时，不要翻开氢气阀门，避免氢气进入柱箱。测定流量时，不管什么原因一定不能让氢气和空气混合，即测氢气时，要关闭空气，反之亦然。